انستيتو پاستور ايران به عنوان يكي از قديمي‌ترين مراكز تحقيقات علوم پزشكي كشور، سابقه ارزشمندي در ارتباط با مراقبت، ريشه‌ كني و كنترل بيماري ها داشته و امروزه با تلاش در جهت همگامي و راه‌اندازي روشهاي نوين تحقيق، توسعه و توليد به همراه آموزش و پژوهش مي‌تواند الگوي مناسبي در سطح كشور، منطقه و جهان باشد.
مركز تحقيقات بيوتكنولوژي كه از سال 76 فعاليت خود را آغاز نموده در قالب بخش بيوتكنولوژي (تاسيس در سال 1374) با 2 عضو هيات علمي شروع به كار نموده ولي امروزه با 30 عضو هيات علمي (PI ) و مجموعاً حدود 200 (كارشناس، دانشجوي دكتراي تخصصي، دكتراي تخصصي پژوهش محور) فعاليت مي‌نمايد. استراتژي مركز، توانمند سازي ساختار نيروي انساني با پذيرش نيروهاي جوان، فعال، خلاق و در اختيار گذاشتن امكانات حمايتي در راستاي اولويتهاي بخش سلامت بوده و با روند توسعه مركز هم‌اكنون حدود بيست درصد نيروهاي تخصصي انستيتو پاستور ايران را شامل ميشود.
دامنه فعاليتهاي مركز در زمينه‌هاي داروهاي پروتيني، تشخيص و كنترل بيماريهاي عفوني، بيماري هاي ژنتيكي و خوني، Drug Discovery، Drug and Insecticide Resistance، ايدز، مالاريا، هليكوباكتر پيلوري ، هاري مي‌باشد.
انتقال تكنولوژي از ديگر زمينه‌هاي فعاليت اين مركز بوده كه در قالب برگزاري كارگاهها وسمينارهاي داخلي و بين المللي (افغانستان، پاكستان، عراق) در مباحث بيوانفورماتيك، Real Time، Cloning، تشخيص، پيشگيري و كنترل بيماريهاي عفوني همچون مالاريا و ... بطور مداوم اجرا مي‌شود.
مشاركت اعضاي هيات علمي مركز در بوردهاي تخصصي به عنوان عضو و دبير (بيوتكنولوژي، ژنتيك، مبارزه با ناقلين و ...)، كميته‌هاي مختلف در معاونتهاي  غذا ودارو و آموزش، كارشناسي مباحث مختلف در سازمان نظام پزشكي، همكاري با روابط بين الملل و تدوين قراردادهاي بين المللي، همكاري در تهيه دستورالعمل‌ها و پروتكل‌هاي كشوري تشخيص و كنترل بيماريها (تشخيص پيش از تولد، مالاريا و پروتين شيمي)، ميزباني 3 شبكه تحقيقاتي كشوري و بين المللي (بيوتكنولوژي پزشكي، پزشكي مولكولي، شرق مديترانه‌اي ژنوميكس و بيوتكنولوژي سلامت) و كانديد بودن به عنوان مركز همكاري WHO براي مالاريا، آزمايشگاه مرجع كشوري مالاريا و در تشخيص قبل از تولد و انتقال تكنولوژي به استانهاي فارس، سيستان بلوچستان، كرمانشاه، اصفهان، آزمايشگاه مرجع كنترل تالاسمي در كشور، داشتن بيشترين دانشجوي بيوتكنولوژي پزشكي، بيوتكنولوژي دارويي و رشته‌هاي مرتبط در داخل و خارج از انستيتو پاستور ايران در قالب پروژه‌هاي ژنوميكس، پروتئوميكس، كشف دارو و داروهاي نوتركيب، اثرگذاري و مشاركت در تغيير خط درمان، تشخيص و درمان بعضي از بيماريها (مالاريا، ليشمانيا و ....)، مشاركت اعضاي هيات علمي مركز تحقيقات بيوتكنولوژي انستيتو پاستور ايران در تدريس واحدهاي آموزش در انستيتو و دانشگاهها در سطح كارشناسي ارشد و دكتراي تخصصي از ديگر فعاليت‌هاي مركز مي باشد.